Mùa đầu tiên của Yumi's Cells theo chân Yumi, một cô gái bình thường đang sống ở Seoul. Phim khám phá cuộc sống hàng ngày của Yumi và những cảm xúc khác nhau mà cô trải qua, từ tình yêu, công việc cho đến các mối quan hệ xã hội. Điểm đặc biệt của phim là sự xuất hiện của các tế bào, đại diện cho những cảm xúc và suy nghĩ của Yumi, như tế bào yêu, tế bào vui vẻ, tế bào buồn, và nhiều hơn nữa. Trong mùa này, Yumi bắt đầu một mối quan hệ lãng mạn với Woong, một nhà thiết kế game. Mối quan hệ của họ trải qua nhiều thăng trầm, từ những khoảnh khắc ngọt ngào đến những thử thách khó khăn. Phim thể hiện sự phát triển của Yumi khi cô học cách yêu thương bản thân và tìm kiếm hạnh phúc.