Sailor Moon Crystal Phần 2 tiếp tục cuộc phiêu lưu của Usagi Tsukino và những người bạn Thủy thủ đoàn khi họ phải đối mặt với những thử thách và kẻ thù mới. Phần này chủ yếu dựa trên phần "Black Moon" trong manga gốc của Naoko Takeuchi.
Khi câu chuyện mở ra, Usagi và những người bạn của cô đối đầu với Black Moon Clan, một nhóm nhân vật phản diện đến từ tương lai quyết tâm chinh phục Trái đất và tiêu diệt Sailor Guardians. Kẻ phản diện bí ẩn và mạnh mẽ, Wiseman, thao túng gia tộc, đặc biệt tập trung vào Chibiusa, con gái của Usagi và Mamoru từ tương lai.
Chibiusa, người ban đầu đến hiện tại để tìm kiếm sự giúp đỡ, đấu tranh với danh tính và nỗi sợ hãi của chính mình. Trong suốt mùa giải, Sailor Guardians nỗ lực bảo vệ cả Chibiusa và thế giới của họ trong khi khám phá ra sự thật đen tối đằng sau ý định của Black Moon Clan.
Chủ đề về tình bạn, tình yêu và sự hy sinh nổi bật khi Usagi trưởng thành trong vai trò là Sailor Moon và học cách dựa vào bạn bè của mình. Mùa này có những trận chiến dữ dội, những khoảnh khắc xúc động và sự xuất hiện của những nhân vật mới, chẳng hạn như Sailor Pluto, người đóng vai trò quan trọng trong bộ phim đang diễn ra.
Với hoạt hình sống động và khám phá sâu hơn về mối quan hệ của các nhân vật, Sailor Moon Crystal Phần 2 thu hút cả người xem mới và người hâm mộ lâu năm của loạt phim.