A Discovery of Witches Season 3 (Mật Mã Phù Thủy - Mùa 3) tiếp nối những sự kiện của mùa 2, khi Diana Bishop và Matthew Clairmont trở về từ thời kỳ Elizabeth để đối mặt với những thách thức mới trong hiện tại. Diana, hiện đang mang thai, tiếp tục tìm kiếm cuốn sách Ashmole 782 và những trang còn thiếu để giải mã bí mật của nó. Cùng với Matthew, cô phải đối mặt với những nguy cơ đến từ Hội đồng phù thủy và các thế lực thù địch khác. Trong khi đó, mối quan hệ giữa phù thủy, ma cà rồng và ác quỷ trở nên căng thẳng hơn bao giờ hết. Diana và Matthew phải tìm cách đoàn kết các loài khác nhau để đối phó với kẻ thù chung và bảo vệ tương lai của họ. Những bí mật gia đình, sự phản bội và tình yêu là những yếu tố chính trong cuộc hành trình đầy kịch tính của họ.